小儿泌尿生殖外科创建于1973年，是国内最早成立的儿童泌尿外科专科之一。2001年成立儿童泌尿生殖疾病中心，2007年成为医院重点学科，2009年获批重庆市医学重点学科，2017年获批儿童泌尿生殖发育与组织工程重点实验室，经过多年积累，已经凝练出鲜明的学科特色，打造出结构合理、团结协作的创新团队，于2023年获批结构性出生缺陷与器官修复重建重庆市重点实验室。

中心拥有多名儿童泌尿外科全国知名专家，包括教授6名，副教授2名，海归学者10名。是国内最早招收小儿泌尿生殖外科硕士、博士研究生单位。现有博士生导师4名，硕士生导师8名。以魏光辉教授为学科带头人的团队先后获得“重庆市工人先锋号”、“重庆市劳模和工匠人才创新工作室”等称号。拥有国务院特殊津贴专家、全国优秀教师、国家卫健委突出贡献中青年专家、国家临床重点专科（小儿外科学）带头人、重庆市首批百名学术学科领军人才、重庆市科技创新领军人才等。历任中华医学会小儿外科分会副主任委员，中国医师协会小儿外科分会副会长等学术任职，担任《中华小儿外科杂志》副总编，《临床小儿外科杂志》副主编等。

常年开放床位90张（渝中院区35张、两江院区55张）；开设全国知名专家门诊及专家专科门诊。每年诊治专科病人逾3万人次，住院患者每年逾3千人次。外阜病人约50%，年住院手术及门诊手术超5千台次，其中Ⅲ级以上大型手术率逾70%。擅长小儿泌尿外科常见病及疑难杂症：先天性肾积水、尿道下裂、泌尿生殖肿瘤、神经源性膀胱、泌尿系结石、隐睾、鞘膜积液、儿童排尿功能障碍（遗尿、尿频、尿失禁）、泌尿系严重外伤等。特色诊疗技术包括：儿童肾移植、传统微创技术、达芬奇手术机器人、肠代膀胱扩大术、复杂尿道断裂修复术、影像尿流动力学检测、膀胱肉毒素注射等。

学科以儿童泌尿生殖发育畸形为重点研究方向，广泛开展相关发病机制与功能修复的基础研究：组织工程与再生医学临床转化、肿瘤精准治疗、儿童肾移植、儿童盆底结构与功能异常等。团队承担科技部支撑项目1项，国家级项目23项，省部级45项，资助经费2000余万元。总计发表论文500余篇，其中SCI论文200余篇，编写专著及教材22部，授权发明专利1项，制定地方行业标准/规范2项。获省部级及厅局级科技奖励8项。培养培养博士后14名，博士生80余名，硕士生195余名。学科综合实力位居全国前列，部分学术成果达到国际先进水平。